Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF26H0Y7S4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF26H0Y7S4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF26H0Y7S4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF26H0Y7S4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF26H0Y7S4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF26H0Y7S4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF26H0Y7S4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms