Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLRF2D3W0D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KLRF2D3W0D1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLRF2D3W0D1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLRF2D3W0D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLRF2D3W0D1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms