Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FITM1A5D6W6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FITM1A5D6W6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FITM1A5D6W6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms