Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FAM50BQ9Y247 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM50BQ9Y247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM50BQ9Y247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM50BQ9Y247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM50BQ9Y247 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms