Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVW-1Q9UQF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVW-1Q9UQF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms