Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA2Q9UL42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PNMA2Q9UL42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA2Q9UL42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms