Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP50Q9UKX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP50Q9UKX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP50Q9UKX7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms