Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUSAP1Q9BXS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUSAP1Q9BXS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUSAP1Q9BXS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUSAP1Q9BXS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293 ms