Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TUBGCP6Q96RT7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUBGCP6Q96RT7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TUBGCP6Q96RT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
TUBGCP6Q96RT7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TUBGCP6Q96RT7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TUBGCP6Q96RT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TUBGCP6Q96RT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TUBGCP6Q96RT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TUBGCP6Q96RT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.5 ms