Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIG1Q96JA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG1Q96JA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIG1Q96JA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms