Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB1CQ92928 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1CQ92928 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB1CQ92928 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms