Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY21

SORCS1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, humanhuman

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1Q8WY21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS1Q8WY21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SORCS1Q8WY21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS1Q8WY21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS1Q8WY21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORCS1Q8WY21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms