Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYOM3Q5VTT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
MYOM3Q5VTT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MYOM3Q5VTT5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
MYOM3Q5VTT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
MYOM3Q5VTT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MYOM3Q5VTT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYOM3Q5VTT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms