Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPTABQ3T906 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNPTABQ3T906 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPTABQ3T906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms