Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRK1Q38SD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRK1Q38SD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRK1Q38SD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRK1Q38SD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRK1Q38SD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms