Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK2Q13002 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
GRIK2Q13002 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIK2Q13002 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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