Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCB1Q12824 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCB1Q12824 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCB1Q12824 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCB1Q12824 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCB1Q12824 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCB1Q12824 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCB1Q12824 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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