Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP2R3AQ06190 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R3AQ06190 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R3AQ06190 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R3AQ06190 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R3AQ06190 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms