Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A5P58743 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC26A5P58743 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A5P58743 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A5P58743 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A5P58743 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms