Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCBP4P57723 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCBP4P57723 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCBP4P57723 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms