Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms