Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT8P50990 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8P50990 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8P50990 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8P50990 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8P50990 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8P50990 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8P50990 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8P50990 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8P50990 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8P50990 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8P50990 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8P50990 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8P50990 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8P50990 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8P50990 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8P50990 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8P50990 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8P50990 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8P50990 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT8P50990 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCT8P50990 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8P50990 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8P50990 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8P50990 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8P50990 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8P50990 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8P50990 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8P50990 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8P50990 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8P50990 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8P50990 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8P50990 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT8P50990 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT8P50990 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT8P50990 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8P50990 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8P50990 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8P50990 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8P50990 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8P50990 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8P50990 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8P50990 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8P50990 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT8P50990 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT8P50990 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT8P50990 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8P50990 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8P50990 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8P50990 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8P50990 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8P50990 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8P50990 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8P50990 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8P50990 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8P50990 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT8P50990 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT8P50990 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8P50990 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8P50990 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8P50990 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8P50990 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8P50990 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8P50990 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8P50990 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8P50990 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8P50990 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8P50990 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8P50990 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8P50990 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8P50990 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8P50990 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms