Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND2P30279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND2P30279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND2P30279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND2P30279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCND2P30279 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCND2P30279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCND2P30279 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCND2P30279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCND2P30279 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCND2P30279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCND2P30279 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND2P30279 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCND2P30279 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCND2P30279 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND2P30279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCND2P30279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCND2P30279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCND2P30279 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND2P30279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND2P30279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND2P30279 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND2P30279 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND2P30279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND2P30279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND2P30279 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND2P30279 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND2P30279 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND2P30279 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND2P30279 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND2P30279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND2P30279 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND2P30279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND2P30279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND2P30279 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND2P30279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND2P30279 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND2P30279 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND2P30279 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND2P30279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND2P30279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCND2P30279 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCND2P30279 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCND2P30279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND2P30279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND2P30279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND2P30279 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND2P30279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND2P30279 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND2P30279 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND2P30279 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCND2P30279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCND2P30279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCND2P30279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCND2P30279 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCND2P30279 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND2P30279 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND2P30279 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCND2P30279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCND2P30279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND2P30279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND2P30279 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCND2P30279 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCND2P30279 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCND2P30279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND2P30279 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND2P30279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND2P30279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND2P30279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND2P30279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCND2P30279 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCND2P30279 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCND2P30279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCND2P30279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms