Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN2P17655 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN2P17655 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAPN2P17655 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN2P17655 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms