Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPC1P11940 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PABPC1P11940 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PABPC1P11940 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PABPC1P11940 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms