Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBP11277 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBP11277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBP11277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTBP11277 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTBP11277 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBP11277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBP11277 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBP11277 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBP11277 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBP11277 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBP11277 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBP11277 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBP11277 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBP11277 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBP11277 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBP11277 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBP11277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBP11277 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBP11277 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBP11277 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBP11277 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBP11277 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBP11277 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBP11277 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBP11277 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBP11277 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBP11277 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBP11277 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBP11277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBP11277 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBP11277 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBP11277 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBP11277 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBP11277 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBP11277 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBP11277 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBP11277 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBP11277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBP11277 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBP11277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBP11277 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBP11277 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBP11277 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBP11277 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBP11277 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBP11277 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBP11277 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBP11277 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBP11277 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBP11277 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBP11277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBP11277 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBP11277 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBP11277 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBP11277 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBP11277 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBP11277 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBP11277 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBP11277 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBP11277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBP11277 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBP11277 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBP11277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBP11277 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBP11277 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBP11277 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBP11277 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBP11277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms