Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCBP05771 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCBP05771 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCBP05771 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCBP05771 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCBP05771 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCBP05771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCBP05771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCBP05771 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCBP05771 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCBP05771 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCBP05771 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms