Protein–RNA interactions for Protein: O75165

DNAJC13, DnaJ homolog subfamily C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC13O75165 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC13O75165 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC13O75165 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC13O75165 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC13O75165 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC13O75165 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC13O75165 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC13O75165 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC13O75165 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC13O75165 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms