Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD2O60906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD2O60906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD2O60906 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms