Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3O43617 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC3O43617 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3O43617 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3O43617 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3O43617 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms