Protein–RNA interactions for Protein: B9A039

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9A039 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B9A039 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B9A039 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B9A039 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B9A039 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B9A039 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B9A039 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B9A039 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B9A039 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
B9A039 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
B9A039 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B9A039 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B9A039 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B9A039 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B9A039 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B9A039 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B9A039 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B9A039 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B9A039 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B9A039 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B9A039 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B9A039 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B9A039 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B9A039 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B9A039 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B9A039 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
B9A039 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
B9A039 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B9A039 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B9A039 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B9A039 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B9A039 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B9A039 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B9A039 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B9A039 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B9A039 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B9A039 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B9A039 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B9A039 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B9A039 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B9A039 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B9A039 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
B9A039 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B9A039 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B9A039 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B9A039 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B9A039 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B9A039 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B9A039 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B9A039 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B9A039 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B9A039 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B9A039 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B9A039 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B9A039 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B9A039 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B9A039 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B9A039 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms