Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL13PA6NNM8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL13PA6NNM8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL13PA6NNM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL13PA6NNM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL13PA6NNM8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms