Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV23-1A0A0A0MS06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV23-1A0A0A0MS06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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