Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms