RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607711.1

AL136162.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AL136162.1, Length 1,078 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL136162.1-201ENST00000607711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.25■■■■■ 6.43
AL136162.1-201ENST00000607711 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.34■■■■■ 5.49
AL136162.1-201ENST00000607711 ABCC9O60706 1549 aa48.99■■■■■ 5.43
AL136162.1-201ENST00000607711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.79■■■■■ 5.08
AL136162.1-201ENST00000607711 NACADO15069 1562 aa46.57■■■■■ 5.05
AL136162.1-201ENST00000607711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.54■■■■■ 5.04
AL136162.1-201ENST00000607711 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.05■■■■■ 4.96
AL136162.1-201ENST00000607711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
AL136162.1-201ENST00000607711 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.71■■■■■ 4.91
AL136162.1-201ENST00000607711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.66■■■■■ 4.9
AL136162.1-201ENST00000607711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.63■■■■■ 4.9
AL136162.1-201ENST00000607711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.53■■■■■ 4.88
AL136162.1-201ENST00000607711 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.38■■■■■ 4.86
AL136162.1-201ENST00000607711 SCRIBQ14160 1630 aa45.04■■■■■ 4.8
AL136162.1-201ENST00000607711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.83■■■■■ 4.77
AL136162.1-201ENST00000607711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
AL136162.1-201ENST00000607711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
AL136162.1-201ENST00000607711 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.07■■■■■ 4.65
AL136162.1-201ENST00000607711 NCAPD3P42695 1498 aa43■■■■■ 4.47
AL136162.1-201ENST00000607711 SMARCA4P51532 1647 aa42.99■■■■■ 4.47
AL136162.1-201ENST00000607711 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.94■■■■■ 4.46
AL136162.1-201ENST00000607711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
AL136162.1-201ENST00000607711 SMARCA2P51531 1590 aa42.84■■■■■ 4.45
AL136162.1-201ENST00000607711 HMGXB3Q12766 1538 aa42.71■■■■■ 4.43
AL136162.1-201ENST00000607711 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.58■■■■■ 4.41
AL136162.1-201ENST00000607711 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
AL136162.1-201ENST00000607711 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.54■■■■■ 4.4
AL136162.1-201ENST00000607711 ERCC6Q03468 1493 aa42.28■■■■■ 4.36
AL136162.1-201ENST00000607711 NESP48681 1621 aa42.19■■■■■ 4.34
AL136162.1-201ENST00000607711 WIZO95785 1651 aa42.09■■■■■ 4.33
AL136162.1-201ENST00000607711 CUX2O14529 1486 aa42■■■■■ 4.31
AL136162.1-201ENST00000607711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
AL136162.1-201ENST00000607711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
AL136162.1-201ENST00000607711 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.74■■■■■ 4.27
AL136162.1-201ENST00000607711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.73■■■■■ 4.27
AL136162.1-201ENST00000607711 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
AL136162.1-201ENST00000607711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
AL136162.1-201ENST00000607711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
AL136162.1-201ENST00000607711 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.48■■■■■ 4.23
AL136162.1-201ENST00000607711 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.34■■■■■ 4.21
AL136162.1-201ENST00000607711 CFTRP13569 1480 aa41.33■■■■■ 4.21
AL136162.1-201ENST00000607711 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.27■■■■■ 4.2
AL136162.1-201ENST00000607711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.26■■■■■ 4.2
AL136162.1-201ENST00000607711 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
AL136162.1-201ENST00000607711 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.14■■■■■ 4.18
AL136162.1-201ENST00000607711 PRDM2Q13029 1718 aa40.89■■■■■ 4.14
AL136162.1-201ENST00000607711 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
AL136162.1-201ENST00000607711 TOPBP1Q92547 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
AL136162.1-201ENST00000607711 ABCC8Q09428 1581 aa40.47■■■■■ 4.07
AL136162.1-201ENST00000607711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
AL136162.1-201ENST00000607711 IFT140Q96RY7 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
AL136162.1-201ENST00000607711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.4■■■■■ 4.06
AL136162.1-201ENST00000607711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
AL136162.1-201ENST00000607711 OSCARQ8IYS5 282 aa40.2■■■■■ 4.03
AL136162.1-201ENST00000607711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
AL136162.1-201ENST00000607711 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
AL136162.1-201ENST00000607711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
AL136162.1-201ENST00000607711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
AL136162.1-201ENST00000607711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40■■■■□ 3.99
AL136162.1-201ENST00000607711 SOGA1O94964 1423 aa39.99■■■■□ 3.99
AL136162.1-201ENST00000607711 CUX1P39880 1505 aa39.98■■■■□ 3.99
AL136162.1-201ENST00000607711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.96■■■■□ 3.99
AL136162.1-201ENST00000607711 TRIM41Q8WV44 630 aa39.92■■■■□ 3.98
AL136162.1-201ENST00000607711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
AL136162.1-201ENST00000607711 FBLN2P98095 1184 aa39.72■■■■□ 3.95
AL136162.1-201ENST00000607711 WDR97A6NE52 1622 aa39.72■■■■□ 3.95
AL136162.1-201ENST00000607711 CHD1O14646 1710 aa39.69■■■■□ 3.94
AL136162.1-201ENST00000607711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.62■■■■□ 3.93
AL136162.1-201ENST00000607711 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.58■■■■□ 3.93
AL136162.1-201ENST00000607711 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.58■■■■□ 3.93
AL136162.1-201ENST00000607711 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.58■■■■□ 3.93
AL136162.1-201ENST00000607711 GRIN2BQ13224 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
AL136162.1-201ENST00000607711 ARHGEF11O15085 1522 aa39.52■■■■□ 3.92
AL136162.1-201ENST00000607711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.51■■■■□ 3.92
AL136162.1-201ENST00000607711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
AL136162.1-201ENST00000607711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
AL136162.1-201ENST00000607711 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
AL136162.1-201ENST00000607711 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
AL136162.1-201ENST00000607711 TOP2BQ02880 1626 aa39.45■■■■□ 3.91
AL136162.1-201ENST00000607711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.43■■■■□ 3.9
AL136162.1-201ENST00000607711 SYNJ1O43426 1573 aa39.42■■■■□ 3.9
AL136162.1-201ENST00000607711 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
AL136162.1-201ENST00000607711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
AL136162.1-201ENST00000607711 SYNJ2O15056 1496 aa39.38■■■■□ 3.9
AL136162.1-201ENST00000607711 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.26■■■■□ 3.88
AL136162.1-201ENST00000607711 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.25■■■■□ 3.87
AL136162.1-201ENST00000607711 ARAP1Q96P48 1450 aa39.17■■■■□ 3.86
AL136162.1-201ENST00000607711 ADAMTS12P58397 1594 aa39.08■■■■□ 3.85
AL136162.1-201ENST00000607711 GRIN2AQ12879 1464 aa39.06■■■■□ 3.84
AL136162.1-201ENST00000607711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.03■■■■□ 3.84
AL136162.1-201ENST00000607711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.02■■■■□ 3.84
AL136162.1-201ENST00000607711 NUP160Q12769 1436 aa38.89■■■■□ 3.82
AL136162.1-201ENST00000607711 CEP170Q5SW79 1584 aa38.88■■■■□ 3.81
AL136162.1-201ENST00000607711 KIF27Q86VH2 1401 aa38.73■■■■□ 3.79
AL136162.1-201ENST00000607711 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
AL136162.1-201ENST00000607711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.7■■■■□ 3.79
AL136162.1-201ENST00000607711 IGF1RP08069 1367 aa38.66■■■■□ 3.78
AL136162.1-201ENST00000607711 SHROOM2Q13796 1616 aa38.65■■■■□ 3.78
AL136162.1-201ENST00000607711 CUL7Q14999 1698 aa38.55■■■■□ 3.76
AL136162.1-201ENST00000607711 JPH4Q96JJ6 628 aa38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.1 ms