RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468148.5

RAB23-202, Transcript of RAB23, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB23, Length 4,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23-202ENST00000468148 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.35■■■□□ 2.29
RAB23-202ENST00000468148 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.62■■■□□ 2.17
RAB23-202ENST00000468148 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
RAB23-202ENST00000468148 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.12■■■□□ 2.09
RAB23-202ENST00000468148 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.43■■□□□ 1.98
RAB23-202ENST00000468148 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.21■■□□□ 1.95
RAB23-202ENST00000468148 MYT1Q01538 1121 aa27.13■■□□□ 1.93
RAB23-202ENST00000468148 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RAB23-202ENST00000468148 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
RAB23-202ENST00000468148 HRCP23327 699 aa26.71■■□□□ 1.87
RAB23-202ENST00000468148 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RAB23-202ENST00000468148 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
RAB23-202ENST00000468148 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
RAB23-202ENST00000468148 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.27■■□□□ 1.8
RAB23-202ENST00000468148 TRIM41Q8WV44 630 aa26.21■■□□□ 1.79
RAB23-202ENST00000468148 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.18■■□□□ 1.78
RAB23-202ENST00000468148 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
RAB23-202ENST00000468148 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
RAB23-202ENST00000468148 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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RAB23-202ENST00000468148 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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RAB23-202ENST00000468148 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB23-202ENST00000468148 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.14■■□□□ 1.61
RAB23-202ENST00000468148 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RAB23-202ENST00000468148 NEFLP07196 543 aa25.03■■□□□ 1.6
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RAB23-202ENST00000468148 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RAB23-202ENST00000468148 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.92■■□□□ 1.58
RAB23-202ENST00000468148 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.85■■□□□ 1.57
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RAB23-202ENST00000468148 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RAB23-202ENST00000468148 NEUROD1Q13562 356 aa24.67■■□□□ 1.54
RAB23-202ENST00000468148 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
RAB23-202ENST00000468148 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RAB23-202ENST00000468148 BCANQ96GW7 911 aa24.51■■□□□ 1.51
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RAB23-202ENST00000468148 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.19■■□□□ 1.46
RAB23-202ENST00000468148 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB23-202ENST00000468148 MIER1Q8N108 512 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB23-202ENST00000468148 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.12■■□□□ 1.45
RAB23-202ENST00000468148 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RAB23-202ENST00000468148 ABCC9O60706 1549 aa24.05■■□□□ 1.44
RAB23-202ENST00000468148 ANP32CO43423 234 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB23-202ENST00000468148 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
RAB23-202ENST00000468148 FKBP8Q14318 412 aa23.94■■□□□ 1.42
RAB23-202ENST00000468148 SCRIBQ14160 1630 aa23.92■■□□□ 1.42
RAB23-202ENST00000468148 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RAB23-202ENST00000468148 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RAB23-202ENST00000468148 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
RAB23-202ENST00000468148 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.84■■□□□ 1.41
RAB23-202ENST00000468148 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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RAB23-202ENST00000468148 P3H3Q8IVL6 736 aa23.64■■□□□ 1.38
RAB23-202ENST00000468148 CEP162Q5TB80 1403 aa23.64■■□□□ 1.38
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RAB23-202ENST00000468148 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RAB23-202ENST00000468148 CLIP1P30622 1438 aa23.49■■□□□ 1.35
RAB23-202ENST00000468148 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.49■■□□□ 1.35
RAB23-202ENST00000468148 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RAB23-202ENST00000468148 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RAB23-202ENST00000468148 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RAB23-202ENST00000468148 TONSLQ96HA7 1378 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB23-202ENST00000468148 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
RAB23-202ENST00000468148 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.38■■□□□ 1.33
RAB23-202ENST00000468148 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.38■■□□□ 1.33
RAB23-202ENST00000468148 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RAB23-202ENST00000468148 NBR1Q14596 966 aa23.32■■□□□ 1.32
RAB23-202ENST00000468148 GOLGA3Q08378 1498 aa23.32■■□□□ 1.32
RAB23-202ENST00000468148 SLC24A1O60721 1099 aa23.31■■□□□ 1.32
RAB23-202ENST00000468148 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.3■■□□□ 1.32
RAB23-202ENST00000468148 ARID3CA6NKF2 412 aa23.29■■□□□ 1.32
RAB23-202ENST00000468148 EEA1Q15075 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB23-202ENST00000468148 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB23-202ENST00000468148 SOGA1O94964 1423 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB23-202ENST00000468148 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB23-202ENST00000468148 MRS2Q9HD23 443 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB23-202ENST00000468148 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.15■■□□□ 1.3
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RAB23-202ENST00000468148 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB23-202ENST00000468148 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB23-202ENST00000468148 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
RAB23-202ENST00000468148 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB23-202ENST00000468148 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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RAB23-202ENST00000468148 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB23-202ENST00000468148 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.05■■□□□ 1.28
RAB23-202ENST00000468148 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
RAB23-202ENST00000468148 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.02■■□□□ 1.28
RAB23-202ENST00000468148 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB23-202ENST00000468148 ABCC8Q09428 1581 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB23-202ENST00000468148 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RAB23-202ENST00000468148 TMC1Q8TDI8 760 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB23-202ENST00000468148 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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