RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341694.6

DCTN3-202, Transcript of dynactin subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DCTN3, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3-202ENST00000341694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.13■■■■■ 5.78
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DCTN3-202ENST00000341694 ABCC9O60706 1549 aa43.94■■■■■ 4.63
DCTN3-202ENST00000341694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
DCTN3-202ENST00000341694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.6■■■■■ 4.41
DCTN3-202ENST00000341694 NACADO15069 1562 aa42.48■■■■■ 4.39
DCTN3-202ENST00000341694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.43■■■■■ 4.38
DCTN3-202ENST00000341694 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.34■■■■■ 4.37
DCTN3-202ENST00000341694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.31■■■■■ 4.36
DCTN3-202ENST00000341694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.44■■■■■ 4.22
DCTN3-202ENST00000341694 SCRIBQ14160 1630 aa41.34■■■■■ 4.21
DCTN3-202ENST00000341694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
DCTN3-202ENST00000341694 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.13■■■■■ 4.18
DCTN3-202ENST00000341694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
DCTN3-202ENST00000341694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
DCTN3-202ENST00000341694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40■■■■□ 3.99
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DCTN3-202ENST00000341694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.76■■■■□ 3.95
DCTN3-202ENST00000341694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
DCTN3-202ENST00000341694 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
DCTN3-202ENST00000341694 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.42■■■■□ 3.9
DCTN3-202ENST00000341694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.29■■■■□ 3.88
DCTN3-202ENST00000341694 SMARCA2P51531 1590 aa39.24■■■■□ 3.87
DCTN3-202ENST00000341694 NCAPD3P42695 1498 aa39.2■■■■□ 3.87
DCTN3-202ENST00000341694 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.18■■■■□ 3.86
DCTN3-202ENST00000341694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
DCTN3-202ENST00000341694 HMGXB3Q12766 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
DCTN3-202ENST00000341694 WIZO95785 1651 aa39.01■■■■□ 3.84
DCTN3-202ENST00000341694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
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DCTN3-202ENST00000341694 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
DCTN3-202ENST00000341694 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.18■■■■□ 3.7
DCTN3-202ENST00000341694 NESP48681 1621 aa38.14■■■■□ 3.7
DCTN3-202ENST00000341694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.1■■■■□ 3.69
DCTN3-202ENST00000341694 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.09■■■■□ 3.69
DCTN3-202ENST00000341694 CFTRP13569 1480 aa37.94■■■■□ 3.66
DCTN3-202ENST00000341694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.84■■■■□ 3.65
DCTN3-202ENST00000341694 ERCC6Q03468 1493 aa37.84■■■■□ 3.65
DCTN3-202ENST00000341694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.68■■■■□ 3.62
DCTN3-202ENST00000341694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.64■■■■□ 3.62
DCTN3-202ENST00000341694 PRDM2Q13029 1718 aa37.64■■■■□ 3.62
DCTN3-202ENST00000341694 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.56■■■■□ 3.6
DCTN3-202ENST00000341694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
DCTN3-202ENST00000341694 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.42■■■■□ 3.58
DCTN3-202ENST00000341694 CUX2O14529 1486 aa37.29■■■■□ 3.56
DCTN3-202ENST00000341694 WDR62O43379 1518 aa37.27■■■■□ 3.56
DCTN3-202ENST00000341694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
DCTN3-202ENST00000341694 ABCC8Q09428 1581 aa37.1■■■■□ 3.53
DCTN3-202ENST00000341694 TOPBP1Q92547 1522 aa37.08■■■■□ 3.53
DCTN3-202ENST00000341694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.07■■■■□ 3.52
DCTN3-202ENST00000341694 CUX1P39880 1505 aa36.95■■■■□ 3.51
DCTN3-202ENST00000341694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
DCTN3-202ENST00000341694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
DCTN3-202ENST00000341694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.76■■■■□ 3.48
DCTN3-202ENST00000341694 IFT140Q96RY7 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
DCTN3-202ENST00000341694 SYNJ1O43426 1573 aa36.74■■■■□ 3.47
DCTN3-202ENST00000341694 TOP2BQ02880 1626 aa36.73■■■■□ 3.47
DCTN3-202ENST00000341694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.72■■■■□ 3.47
DCTN3-202ENST00000341694 SOGA1O94964 1423 aa36.67■■■■□ 3.46
DCTN3-202ENST00000341694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.64■■■■□ 3.46
DCTN3-202ENST00000341694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
DCTN3-202ENST00000341694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
DCTN3-202ENST00000341694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
DCTN3-202ENST00000341694 WDR97A6NE52 1622 aa36.41■■■■□ 3.42
DCTN3-202ENST00000341694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
DCTN3-202ENST00000341694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
DCTN3-202ENST00000341694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
DCTN3-202ENST00000341694 TRIM41Q8WV44 630 aa36.29■■■■□ 3.4
DCTN3-202ENST00000341694 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
DCTN3-202ENST00000341694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.23■■■■□ 3.39
DCTN3-202ENST00000341694 GRIN2BQ13224 1484 aa36.18■■■■□ 3.38
DCTN3-202ENST00000341694 PBRM1Q86U86 1689 aa36.11■■■■□ 3.37
DCTN3-202ENST00000341694 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.11■■■■□ 3.37
DCTN3-202ENST00000341694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.07■■■■□ 3.37
DCTN3-202ENST00000341694 KIF27Q86VH2 1401 aa36.07■■■■□ 3.36
DCTN3-202ENST00000341694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
DCTN3-202ENST00000341694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.99■■■■□ 3.35
DCTN3-202ENST00000341694 FBLN2P98095 1184 aa35.91■■■■□ 3.34
DCTN3-202ENST00000341694 SYNJ2O15056 1496 aa35.89■■■■□ 3.34
DCTN3-202ENST00000341694 IGF1RP08069 1367 aa35.89■■■■□ 3.34
DCTN3-202ENST00000341694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.88■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 CHD1O14646 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 ADAMTS12P58397 1594 aa35.86■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 OSCARQ8IYS5 282 aa35.85■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
DCTN3-202ENST00000341694 CUL7Q14999 1698 aa35.73■■■■□ 3.31
DCTN3-202ENST00000341694 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.72■■■■□ 3.31
DCTN3-202ENST00000341694 GRIN2AQ12879 1464 aa35.71■■■■□ 3.31
DCTN3-202ENST00000341694 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.68■■■■□ 3.3
DCTN3-202ENST00000341694 EEA1Q15075 1411 aa35.64■■■■□ 3.3
DCTN3-202ENST00000341694 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.56■■■■□ 3.28
DCTN3-202ENST00000341694 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
DCTN3-202ENST00000341694 NUP160Q12769 1436 aa35.54■■■■□ 3.28
DCTN3-202ENST00000341694 CEP170Q5SW79 1584 aa35.51■■■■□ 3.28
DCTN3-202ENST00000341694 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.51■■■■□ 3.27
DCTN3-202ENST00000341694 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.5■■■■□ 3.27
DCTN3-202ENST00000341694 PRXQ9BXM0 1461 aa35.47■■■■□ 3.27
DCTN3-202ENST00000341694 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.3■■■■□ 3.24
DCTN3-202ENST00000341694 ARHGEF11O15085 1522 aa35.24■■■■□ 3.23
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