RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446489.1

AC068580.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC068580.1, Length 252 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068580.1-201ENST00000446489 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.11■■■■■ 6.25
AC068580.1-201ENST00000446489 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.13■■■■■ 5.3
AC068580.1-201ENST00000446489 ABCC9O60706 1549 aa47.62■■■■■ 5.21
AC068580.1-201ENST00000446489 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.57■■■■■ 4.89
AC068580.1-201ENST00000446489 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
AC068580.1-201ENST00000446489 NACADO15069 1562 aa45.43■■■■■ 4.86
AC068580.1-201ENST00000446489 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.01■■■■■ 4.8
AC068580.1-201ENST00000446489 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
AC068580.1-201ENST00000446489 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.7■■■■■ 4.75
AC068580.1-201ENST00000446489 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.53■■■■■ 4.72
AC068580.1-201ENST00000446489 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.41■■■■■ 4.7
AC068580.1-201ENST00000446489 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.18■■■■■ 4.66
AC068580.1-201ENST00000446489 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.1■■■■■ 4.65
AC068580.1-201ENST00000446489 SCRIBQ14160 1630 aa43.99■■■■■ 4.63
AC068580.1-201ENST00000446489 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
AC068580.1-201ENST00000446489 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
AC068580.1-201ENST00000446489 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.98■■■■■ 4.47
AC068580.1-201ENST00000446489 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.81■■■■■ 4.44
AC068580.1-201ENST00000446489 SMARCA4P51532 1647 aa42.02■■■■■ 4.32
AC068580.1-201ENST00000446489 NCAPD3P42695 1498 aa41.98■■■■■ 4.31
AC068580.1-201ENST00000446489 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.95■■■■■ 4.31
AC068580.1-201ENST00000446489 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
AC068580.1-201ENST00000446489 SMARCA2P51531 1590 aa41.84■■■■■ 4.29
AC068580.1-201ENST00000446489 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.71■■■■■ 4.27
AC068580.1-201ENST00000446489 HMGXB3Q12766 1538 aa41.66■■■■■ 4.26
AC068580.1-201ENST00000446489 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.59■■■■■ 4.25
AC068580.1-201ENST00000446489 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
AC068580.1-201ENST00000446489 WIZO95785 1651 aa41.2■■■■■ 4.19
AC068580.1-201ENST00000446489 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
AC068580.1-201ENST00000446489 NESP48681 1621 aa41.09■■■■■ 4.17
AC068580.1-201ENST00000446489 ERCC6Q03468 1493 aa41.08■■■■■ 4.17
AC068580.1-201ENST00000446489 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.86■■■■■ 4.13
AC068580.1-201ENST00000446489 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.77■■■■■ 4.12
AC068580.1-201ENST00000446489 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
AC068580.1-201ENST00000446489 CUX2O14529 1486 aa40.7■■■■■ 4.11
AC068580.1-201ENST00000446489 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.68■■■■■ 4.1
AC068580.1-201ENST00000446489 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.47■■■■■ 4.07
AC068580.1-201ENST00000446489 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
AC068580.1-201ENST00000446489 CFTRP13569 1480 aa40.41■■■■■ 4.06
AC068580.1-201ENST00000446489 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.33■■■■■ 4.05
AC068580.1-201ENST00000446489 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.28■■■■■ 4.04
AC068580.1-201ENST00000446489 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.26■■■■■ 4.03
AC068580.1-201ENST00000446489 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.24■■■■■ 4.03
AC068580.1-201ENST00000446489 WDR62O43379 1518 aa40.09■■■■■ 4.01
AC068580.1-201ENST00000446489 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.99■■■■□ 3.99
AC068580.1-201ENST00000446489 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
AC068580.1-201ENST00000446489 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
AC068580.1-201ENST00000446489 PRDM2Q13029 1718 aa39.88■■■■□ 3.97
AC068580.1-201ENST00000446489 TOPBP1Q92547 1522 aa39.58■■■■□ 3.93
AC068580.1-201ENST00000446489 ABCC8Q09428 1581 aa39.55■■■■□ 3.92
AC068580.1-201ENST00000446489 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.46■■■■□ 3.91
AC068580.1-201ENST00000446489 IFT140Q96RY7 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
AC068580.1-201ENST00000446489 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
AC068580.1-201ENST00000446489 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
AC068580.1-201ENST00000446489 CUX1P39880 1505 aa39.14■■■■□ 3.86
AC068580.1-201ENST00000446489 SOGA1O94964 1423 aa39.12■■■■□ 3.85
AC068580.1-201ENST00000446489 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
AC068580.1-201ENST00000446489 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.1■■■■□ 3.85
AC068580.1-201ENST00000446489 OSCARQ8IYS5 282 aa39.09■■■■□ 3.85
AC068580.1-201ENST00000446489 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.08■■■■□ 3.85
AC068580.1-201ENST00000446489 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.05■■■■□ 3.84
AC068580.1-201ENST00000446489 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
AC068580.1-201ENST00000446489 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
AC068580.1-201ENST00000446489 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
AC068580.1-201ENST00000446489 FBLN2P98095 1184 aa38.75■■■■□ 3.79
AC068580.1-201ENST00000446489 WDR97A6NE52 1622 aa38.74■■■■□ 3.79
AC068580.1-201ENST00000446489 TOP2BQ02880 1626 aa38.67■■■■□ 3.78
AC068580.1-201ENST00000446489 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.67■■■■□ 3.78
AC068580.1-201ENST00000446489 GRIN2BQ13224 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
AC068580.1-201ENST00000446489 SYNJ1O43426 1573 aa38.65■■■■□ 3.78
AC068580.1-201ENST00000446489 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.65■■■■□ 3.78
AC068580.1-201ENST00000446489 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.63■■■■□ 3.77
AC068580.1-201ENST00000446489 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.62■■■■□ 3.77
AC068580.1-201ENST00000446489 CHD1O14646 1710 aa38.58■■■■□ 3.77
AC068580.1-201ENST00000446489 TRIM41Q8WV44 630 aa38.57■■■■□ 3.76
AC068580.1-201ENST00000446489 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
AC068580.1-201ENST00000446489 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
AC068580.1-201ENST00000446489 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.48■■■■□ 3.75
AC068580.1-201ENST00000446489 SYNJ2O15056 1496 aa38.43■■■■□ 3.74
AC068580.1-201ENST00000446489 PBRM1Q86U86 1689 aa38.42■■■■□ 3.74
AC068580.1-201ENST00000446489 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.34■■■■□ 3.73
AC068580.1-201ENST00000446489 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.34■■■■□ 3.73
AC068580.1-201ENST00000446489 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.34■■■■□ 3.73
AC068580.1-201ENST00000446489 ARHGEF11O15085 1522 aa38.34■■■■□ 3.73
AC068580.1-201ENST00000446489 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.2■■■■□ 3.71
AC068580.1-201ENST00000446489 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.17■■■■□ 3.7
AC068580.1-201ENST00000446489 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.17■■■■□ 3.7
AC068580.1-201ENST00000446489 ADAMTS12P58397 1594 aa38.15■■■■□ 3.7
AC068580.1-201ENST00000446489 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.15■■■■□ 3.7
AC068580.1-201ENST00000446489 GRIN2AQ12879 1464 aa38.14■■■■□ 3.7
AC068580.1-201ENST00000446489 KIF27Q86VH2 1401 aa38.04■■■■□ 3.68
AC068580.1-201ENST00000446489 ARAP1Q96P48 1450 aa38.02■■■■□ 3.68
AC068580.1-201ENST00000446489 NUP160Q12769 1436 aa37.98■■■■□ 3.67
AC068580.1-201ENST00000446489 IGF1RP08069 1367 aa37.95■■■■□ 3.67
AC068580.1-201ENST00000446489 CEP170Q5SW79 1584 aa37.93■■■■□ 3.66
AC068580.1-201ENST00000446489 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.71■■■■□ 3.63
AC068580.1-201ENST00000446489 CUL7Q14999 1698 aa37.71■■■■□ 3.63
AC068580.1-201ENST00000446489 JPH4Q96JJ6 628 aa37.7■■■■□ 3.63
AC068580.1-201ENST00000446489 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.68■■■■□ 3.62
AC068580.1-201ENST00000446489 SHROOM2Q13796 1616 aa37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms