RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.65■■■■■ 6.66
CLTB-201ENST00000310418 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.75■■■■■ 5.71
CLTB-201ENST00000310418 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
CLTB-201ENST00000310418 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.22■■■■■ 5.31
CLTB-201ENST00000310418 NACADO15069 1562 aa47.94■■■■■ 5.26
CLTB-201ENST00000310418 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.75■■■■■ 5.23
CLTB-201ENST00000310418 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.33■■■■■ 5.17
CLTB-201ENST00000310418 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.24■■■■■ 5.15
CLTB-201ENST00000310418 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.11■■■■■ 5.13
CLTB-201ENST00000310418 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
CLTB-201ENST00000310418 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
CLTB-201ENST00000310418 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.8■■■■■ 5.08
CLTB-201ENST00000310418 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.8■■■■■ 5.08
CLTB-201ENST00000310418 SCRIBQ14160 1630 aa46.26■■■■■ 5
CLTB-201ENST00000310418 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.99
CLTB-201ENST00000310418 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.69■■■■■ 4.9
CLTB-201ENST00000310418 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
CLTB-201ENST00000310418 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.53■■■■■ 4.88
CLTB-201ENST00000310418 NCAPD3P42695 1498 aa44.25■■■■■ 4.67
CLTB-201ENST00000310418 SMARCA4P51532 1647 aa44.15■■■■■ 4.66
CLTB-201ENST00000310418 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.15■■■■■ 4.66
CLTB-201ENST00000310418 SMARCA2P51531 1590 aa44.04■■■■■ 4.64
CLTB-201ENST00000310418 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
CLTB-201ENST00000310418 HMGXB3Q12766 1538 aa43.94■■■■■ 4.63
CLTB-201ENST00000310418 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
CLTB-201ENST00000310418 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
CLTB-201ENST00000310418 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.66■■■■■ 4.58
CLTB-201ENST00000310418 ERCC6Q03468 1493 aa43.65■■■■■ 4.58
CLTB-201ENST00000310418 CUX2O14529 1486 aa43.5■■■■■ 4.55
CLTB-201ENST00000310418 NESP48681 1621 aa43.49■■■■■ 4.55
CLTB-201ENST00000310418 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.24■■■■■ 4.51
CLTB-201ENST00000310418 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.22■■■■■ 4.51
CLTB-201ENST00000310418 WIZO95785 1651 aa43.14■■■■■ 4.5
CLTB-201ENST00000310418 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
CLTB-201ENST00000310418 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.97■■■■■ 4.47
CLTB-201ENST00000310418 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.94■■■■■ 4.46
CLTB-201ENST00000310418 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.91■■■■■ 4.46
CLTB-201ENST00000310418 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
CLTB-201ENST00000310418 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
CLTB-201ENST00000310418 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.59■■■■■ 4.41
CLTB-201ENST00000310418 WDR62O43379 1518 aa42.47■■■■■ 4.39
CLTB-201ENST00000310418 CFTRP13569 1480 aa42.47■■■■■ 4.39
CLTB-201ENST00000310418 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.46■■■■■ 4.39
CLTB-201ENST00000310418 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.43■■■■■ 4.38
CLTB-201ENST00000310418 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.13■■■■■ 4.34
CLTB-201ENST00000310418 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CLTB-201ENST00000310418 PRDM2Q13029 1718 aa42.06■■■■■ 4.32
CLTB-201ENST00000310418 TOPBP1Q92547 1522 aa41.65■■■■■ 4.26
CLTB-201ENST00000310418 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
CLTB-201ENST00000310418 ABCC8Q09428 1581 aa41.58■■■■■ 4.25
CLTB-201ENST00000310418 OSCARQ8IYS5 282 aa41.55■■■■■ 4.24
CLTB-201ENST00000310418 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.52■■■■■ 4.24
CLTB-201ENST00000310418 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CLTB-201ENST00000310418 TRIM41Q8WV44 630 aa41.45■■■■■ 4.23
CLTB-201ENST00000310418 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CLTB-201ENST00000310418 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
CLTB-201ENST00000310418 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
CLTB-201ENST00000310418 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
CLTB-201ENST00000310418 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CLTB-201ENST00000310418 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.09■■■■■ 4.17
CLTB-201ENST00000310418 SOGA1O94964 1423 aa41.06■■■■■ 4.16
CLTB-201ENST00000310418 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
CLTB-201ENST00000310418 CUX1P39880 1505 aa41.01■■■■■ 4.16
CLTB-201ENST00000310418 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.98■■■■■ 4.15
CLTB-201ENST00000310418 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.98■■■■■ 4.15
CLTB-201ENST00000310418 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.98■■■■■ 4.15
CLTB-201ENST00000310418 CHD1O14646 1710 aa40.96■■■■■ 4.15
CLTB-201ENST00000310418 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CLTB-201ENST00000310418 ARHGEF11O15085 1522 aa40.88■■■■■ 4.13
CLTB-201ENST00000310418 FBLN2P98095 1184 aa40.87■■■■■ 4.13
CLTB-201ENST00000310418 WDR97A6NE52 1622 aa40.86■■■■■ 4.13
CLTB-201ENST00000310418 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.76■■■■■ 4.12
CLTB-201ENST00000310418 GRIN2BQ13224 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
CLTB-201ENST00000310418 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
CLTB-201ENST00000310418 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
CLTB-201ENST00000310418 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.57■■■■■ 4.09
CLTB-201ENST00000310418 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.57■■■■■ 4.08
CLTB-201ENST00000310418 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.56■■■■■ 4.08
CLTB-201ENST00000310418 PBRM1Q86U86 1689 aa40.53■■■■■ 4.08
CLTB-201ENST00000310418 SYNJ2O15056 1496 aa40.52■■■■■ 4.08
CLTB-201ENST00000310418 SYNJ1O43426 1573 aa40.49■■■■■ 4.07
CLTB-201ENST00000310418 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.49■■■■■ 4.07
CLTB-201ENST00000310418 ARAP1Q96P48 1450 aa40.49■■■■■ 4.07
CLTB-201ENST00000310418 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.48■■■■■ 4.07
CLTB-201ENST00000310418 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
CLTB-201ENST00000310418 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.41■■■■■ 4.06
CLTB-201ENST00000310418 TOP2BQ02880 1626 aa40.4■■■■■ 4.06
CLTB-201ENST00000310418 ADAMTS12P58397 1594 aa40.16■■■■■ 4.02
CLTB-201ENST00000310418 GRIN2AQ12879 1464 aa40.16■■■■■ 4.02
CLTB-201ENST00000310418 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CLTB-201ENST00000310418 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.06■■■■■ 4
CLTB-201ENST00000310418 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.06■■■■■ 4
CLTB-201ENST00000310418 NUP160Q12769 1436 aa40.01■■■■■ 4
CLTB-201ENST00000310418 CEP170Q5SW79 1584 aa40■■■■□ 3.99
CLTB-201ENST00000310418 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.88■■■■□ 3.97
CLTB-201ENST00000310418 SHROOM2Q13796 1616 aa39.81■■■■□ 3.96
CLTB-201ENST00000310418 KIF27Q86VH2 1401 aa39.63■■■■□ 3.93
CLTB-201ENST00000310418 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
CLTB-201ENST00000310418 JPH4Q96JJ6 628 aa39.61■■■■□ 3.93
CLTB-201ENST00000310418 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.59■■■■□ 3.93
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