RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.75■■■■■ 4.75
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UBXN6-201ENST00000301281 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.96■■■■□ 3.51
UBXN6-201ENST00000301281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
UBXN6-201ENST00000301281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.76■■■■□ 3.48
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC9O60706 1549 aa36.44■■■■□ 3.42
UBXN6-201ENST00000301281 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.37■■■■□ 3.41
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UBXN6-201ENST00000301281 SCRIBQ14160 1630 aa35.85■■■■□ 3.33
UBXN6-201ENST00000301281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.67■■■■□ 3.3
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UBXN6-201ENST00000301281 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-201ENST00000301281 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
UBXN6-201ENST00000301281 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.68■■■■□ 3.14
UBXN6-201ENST00000301281 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.63■■■■□ 3.13
UBXN6-201ENST00000301281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
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UBXN6-201ENST00000301281 WIZO95785 1651 aa34.39■■■■□ 3.1
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UBXN6-201ENST00000301281 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.2■■■■□ 3.06
UBXN6-201ENST00000301281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
UBXN6-201ENST00000301281 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.9■■■■□ 3.02
UBXN6-201ENST00000301281 SMARCA2P51531 1590 aa33.72■■■□□ 2.99
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UBXN6-201ENST00000301281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.66■■■□□ 2.98
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.64■■■□□ 2.98
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UBXN6-201ENST00000301281 HMGXB3Q12766 1538 aa33.3■■■□□ 2.92
UBXN6-201ENST00000301281 NCAPD3P42695 1498 aa33.27■■■□□ 2.92
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC8Q09428 1581 aa33.13■■■□□ 2.89
UBXN6-201ENST00000301281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.99■■■□□ 2.87
UBXN6-201ENST00000301281 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.92■■■□□ 2.86
UBXN6-201ENST00000301281 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
UBXN6-201ENST00000301281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.78■■■□□ 2.84
UBXN6-201ENST00000301281 SYNJ1O43426 1573 aa32.72■■■□□ 2.83
UBXN6-201ENST00000301281 CFTRP13569 1480 aa32.66■■■□□ 2.82
UBXN6-201ENST00000301281 PRDM2Q13029 1718 aa32.58■■■□□ 2.81
UBXN6-201ENST00000301281 SOGA1O94964 1423 aa32.54■■■□□ 2.8
UBXN6-201ENST00000301281 TOP2BQ02880 1626 aa32.51■■■□□ 2.8
UBXN6-201ENST00000301281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.49■■■□□ 2.79
UBXN6-201ENST00000301281 EEA1Q15075 1411 aa32.45■■■□□ 2.78
UBXN6-201ENST00000301281 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.44■■■□□ 2.78
UBXN6-201ENST00000301281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.42■■■□□ 2.78
UBXN6-201ENST00000301281 CUX1P39880 1505 aa32.36■■■□□ 2.77
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UBXN6-201ENST00000301281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.22■■■□□ 2.75
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UBXN6-201ENST00000301281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.12■■■□□ 2.73
UBXN6-201ENST00000301281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.1■■■□□ 2.73
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UBXN6-201ENST00000301281 CEP162Q5TB80 1403 aa31.93■■■□□ 2.7
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UBXN6-201ENST00000301281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
UBXN6-201ENST00000301281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.79■■■□□ 2.68
UBXN6-201ENST00000301281 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.79■■■□□ 2.68
UBXN6-201ENST00000301281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.78■■■□□ 2.68
UBXN6-201ENST00000301281 CUX2O14529 1486 aa31.77■■■□□ 2.68
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UBXN6-201ENST00000301281 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.63■■■□□ 2.65
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UBXN6-201ENST00000301281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.39■■■□□ 2.62
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UBXN6-201ENST00000301281 WDR62O43379 1518 aa31.28■■■□□ 2.6
UBXN6-201ENST00000301281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
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UBXN6-201ENST00000301281 ERCC6Q03468 1493 aa31.15■■■□□ 2.58
UBXN6-201ENST00000301281 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
UBXN6-201ENST00000301281 PBRM1Q86U86 1689 aa31.12■■■□□ 2.57
UBXN6-201ENST00000301281 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.09■■■□□ 2.57
UBXN6-201ENST00000301281 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
UBXN6-201ENST00000301281 IFT140Q96RY7 1462 aa31.07■■■□□ 2.56
UBXN6-201ENST00000301281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.552e-7■■■■■ 31.9
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
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