Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAP3K4Q9Y6R4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
MAP3K4Q9Y6R4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
MAP3K4Q9Y6R4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAP3K4Q9Y6R4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
MAP3K4Q9Y6R4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms