Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB2Q9Y5G2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGB2Q9Y5G2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGB2Q9Y5G2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB2Q9Y5G2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGB2Q9Y5G2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms