Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB13Q9Y5F0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB13Q9Y5F0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHB13Q9Y5F0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB13Q9Y5F0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB13Q9Y5F0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB13Q9Y5F0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB13Q9Y5F0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB13Q9Y5F0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms