Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP3Q9Y446 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP3Q9Y446 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP3Q9Y446 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP3Q9Y446 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP3Q9Y446 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms