Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDZRN3Q9UPQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDZRN3Q9UPQ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PDZRN3Q9UPQ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms