Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP18Q9UMW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP18Q9UMW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP18Q9UMW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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