Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT6Q9ULM6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT6Q9ULM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6Q9ULM6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6Q9ULM6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT6Q9ULM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms