Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL1Q9UKG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL1Q9UKG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL1Q9UKG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL1Q9UKG1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms