Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO9Q9UK97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO9Q9UK97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms