Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCP2D1Q9UJQ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCP2D1Q9UJQ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms